Ligation Rechner
Bei einer Ligation wird ein DNA-Stück, das Insert, in einen Vektor eingebaut, das Plasmid, in das es kommt. Diese Seite berechnet, wie viel Insert du nach Masse zugeben musst, für das gewählte Molverhältnis. Ändere eine Zahl, und das Ergebnis passt sich an.
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So funktioniert es
Die Insertmasse ergibt sich aus der Vektormasse mal der Insertlänge, geteilt durch die Vektorlänge, und dann mal dem Molverhältnis. Ein längeres Insert wiegt bei gleicher Molekülzahl mehr, deshalb ist der Größenvergleich wichtig.
Ein Molverhältnis von 3 zu 1 ist ein üblicher Ausgangspunkt, aber viele Protokolle empfehlen, ein paar Verhältnisse zu testen. Für deine Reaktion gilt zuletzt die Anleitung deines Enzymkits.
Rechenbeispiel
Ein Vektor mit 3.000 bp und 100 ng DNA sowie ein Insert mit 1.000 bp brauchen bei einem Molverhältnis von 3 100 ng Insert.
Fragen
Was ist ein Molverhältnis?
Es gibt an, wie viele Insert-Moleküle du pro Vektor-Molekül zugibst. Ein Verhältnis von 3 zu 1 bedeutet drei Insert-Moleküle für jedes Vektor-Molekül.
Warum ändert sich die Masse mit der Insertgröße?
Die Masse hängt von Größe und Anzahl ab. Ein längeres Insert wiegt mehr, deshalb braucht die gleiche Molekülzahl mehr Nanogramm.
Kann ich das für jedes Kit nutzen?
Es nutzt die übliche Insert-und-Vektor-Rechnung. Manche Kits empfehlen eigene Mengen, schau also auch im Protokoll deines Kits nach.
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