Calcolatore ligazione
Una ligazione unisce un pezzo di DNA, l'inserto, a un vettore, il plasmide in cui viene inserito. Questa pagina calcola quanto inserto aggiungere, in massa, per il rapporto molare che scegli. Cambia un numero e il risultato si aggiorna.
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Come funziona
La massa dell'inserto è uguale alla massa del vettore per la lunghezza dell'inserto, diviso la lunghezza del vettore, poi per il rapporto molare. Un inserto più lungo pesa di più a parità di molecole, quindi il confronto di dimensioni conta.
Un rapporto molare di 3 a 1 è un punto di partenza comune, ma molti protocolli suggeriscono di provare alcuni rapporti. Le istruzioni del tuo kit enzimatico hanno l'ultima parola per la tua reazione.
Esempio svolto
Un vettore di 3000 bp con 100 ng di DNA e un inserto di 1000 bp, con rapporto molare di 3, richiede 100 ng di inserto.
Domande
Cos'è il rapporto molare?
È quante molecole di inserto aggiungi per ogni molecola di vettore. Un rapporto 3 a 1 significa tre molecole di inserto per ogni molecola di vettore.
Perché la massa cambia con la dimensione dell'inserto?
La massa dipende dalla dimensione oltre che dal numero. Un inserto più lungo pesa di più, quindi lo stesso numero di molecole richiede più nanogrammi.
Posso usarlo con qualsiasi kit?
Usa il calcolo standard per inserto e vettore. Alcuni kit consigliano quantità proprie, quindi controlla anche il protocollo del tuo kit.
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